звільнення за згодою сторін п.1 частина 1 ст.36 КЗпП України

яку компенсацію маєте на увазі? Може вихідну допомогу? Вихідна допомога по п. 1 ч. 1 ст. 36 КЗпП не виплачується.

чи п. 5 ч. 1 ст. 41? Як на мене, то це не ваш випадок. Це звільнення я розумію як звільнення за рішенням засновників "бо їм так хочеться". Керівник - це 2в1: найманий працівник і орган управління. Коли засновники його як орган управління позбавляють повноважень, це підстава для звільнення його як найманого працівника. 

Але я так розумію, у вас щось бюджетне? То дивіться що там ваші внутрішні циркуляри на цю тему кажуть. Але я тут припинення повноважень за рішенням власників не бачу.